软下疳患者若不及时发现和治疗可发生各种并发症，如：包皮炎和嵌顿包茎，软下疳性淋巴结炎，继发感染及尿道瘘。
1、尿道瘘
阴茎部软下疳可造成阴茎毁坏性溃疡而侵犯及尿道，可引起排尿剧痛，最后可导致尿道狭窄，排尿困难。
2、包皮炎和嵌顿包茎
当患者在包皮内发生软下疳时，可因炎症水肿而造成包皮炎性包茎，包皮内脓汁积潴可引起龟头炎。如果包皮高度水肿不能翻转时则可引起嵌顿包茎。
3、继发感染
在感染软下疳的同时少数病人还可继发感染梅毒和性病性淋巴肉芽肿等，可以增加损害的严重性，此时可发生混合性下疳，往往难以治疗。
4、软下疳性淋巴结炎
又称软下疳性横痃或痛性横痃，50-60%患者可以发生，多在软下疳溃疡出现后数天到了周内发生。以腹股沟多见，常为单侧性，开始为局部淋巴结肿大，有轻微压痛，然后可逐步累及邻近多个淋巴结，并产生淋巴结周围炎，彼此可融合成较大的团块。局部皮肤可红肿，触之有波动感，最后可破溃而形成溃疡。此时患者可有明显的疼痛，还可伴有发烧，常需2-4周才逐步愈合形成疤痕。
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