蝶腭神经痛和三叉神经痛神经支配的位置不同。蝶腭神经主要支配位置是以鼻部为主,疼痛主要是鼻粘膜、鼻部的疼痛,范围要比三叉神经痛的范围要小的多,并且疼痛的性质和三叉神经痛有很大区别。三叉神经痛的疼痛是刀割样、电击样还有烧灼样,或者是有诱发点、扳击点,即诱发的部位;而蝶腭神经痛是一种持续性的疼痛,不是阵发性的疼痛,如果疼痛出现以后,表现为持续性疼痛,并且疼痛的部位以鼻部周围为主,则为蝶腭神经痛。三叉神经痛疼痛的部位是整个半侧的脸或者是额部、上颌部和下颌部,甚至有时候三支出现疼痛,导致整个脸的疼痛和麻木。这种疼痛相对于蝶腭神经的疼痛来说是难以忍受。