术前静脉应用抗生素、手术时采用双重手套和严格的无菌操作以避免脑脊液漏等仍难阻止术后感染的发生。需进行长程使用抗菌素、抗菌药物使用。研究发现局部应用抗生素粉于心脏、脊髓以及DBS等手术中防控感染获得很大的成功。有人对脑室腹腔分流术患儿局部应用抗生素杆菌肽粉预防术后感染。结果发现局部使用杆菌肽粉与术后感染率低密切相关。证实局部使用杆菌肽粉是降低术后感染率的独立影响因子。而且局部使用杆菌肽粉患儿均未发生过敏和伤口裂开等并发症。头皮切口缝合前局部应用抗生素杆菌肽粉可以有效地降低脑室腹腔分流术后感染的发生率。