胃肠道间质瘤的危害根据肿瘤的大小、发生部位的不同以及它的危险度的分级的不同而不同。一些低危的胃肠道间质瘤可以视为是良性,它相对的危害比较小。对一些中高危的胃肠间质瘤患者,就是我们常说的恶性肿瘤,恶性肿瘤的最大特点就是转移和浸润,比如胃肠道间质瘤会发生肝转移、骨转移、肺转移甚至脑转移,如果转移到远处,说明胃肠道间质瘤就属于很晚期的病变,会导致很多的并发症,如果胃肠道间质瘤生长在特殊的部位,比如十二指肠,又发生了浸润,这样就会大范围的进行手术切除,包括一些胰头、十二指肠、胆管等,会给患者的身体以及经济带来很大的负担,如果胃肠间质瘤生长于直肠,会切除肛门进行乙状结肠造瘘,给患者的工作和生活带来很大的不便。