药流第3天疼痛可能会持续30分钟到6个小时左右，由于妊娠囊排出的速度不同、对药物的敏感程度不同等，都会对药流第3天疼痛的时间造成影响，所以具体的时间因人而异。
对于怀孕49天以内的女性，无流产药物使用禁忌症时，可以选择药物流产，药物流产的药物包括米非司酮片、米索前列醇片，一般在前2天需要服用米非司酮片来杀死孕囊，有些女性可能会出现轻微的腹痛、腹泻、恶心、呕吐等不适症状。第3天时需要口服米索前列醇片，可以促进子宫收缩、软化宫颈，使孕囊排出体外，在服用药物后会出现腹痛、阴道流血等症状，这个时候所出现的腹部疼痛更为明显一些，一般孕囊排出后，腹痛症状会逐渐改善，所以，腹部疼痛的时间与孕囊排出的早晚有一定关系，孕囊排出时间比较早者，腹痛时间比较短；孕囊排出比较晚者，腹痛时间多会比较长。
在进行药物流产时，很有可能会存在药流不全现象，当宫腔内有残留物时，多会出现阴道流血淋漓不断、腹部持续性疼痛等症状，所以，药物流产后腹部疼痛症状超过6小时者，建议及时去医院就诊，进行子宫附件B超检查，必要时进行清宫处理。
