NGU症状常持续数月之久，短时间内不易消失，且有发生潜在合并症的危险。因此，一经确诊，应积极治疗。但目前对NGU的治疗尚无统一的认识。四环素类药物由于对沙眼衣原体及解脲支原体均能起到有效的杀灭作用，被作为治疗NGU的首选药物。
一.治疗注意事项：
1.必须同时检查和治疗NGU的性伴侣，方能避免再感染。
2.磺胺只对衣原体感染有效，青霉素对NGU无效。
3.如为滴虫、霉菌或其他的病原菌，应在查清后作相应的治疗。
4.若患者常反复发作，应警惕存在并发症(如前列腺炎)，并作相应治疗。
5.如病人经多次重复治疗后症状无改善，仍有一些非典型症状，但非急性期的表现，就可以停止抗生素治疗，绝大多数病人的症状经一段时间后能自行缓解。
二.治疗方案：选择对衣原体、支原体均有效的药物。
(1)尿道炎(黏液脓性宫颈炎)：多西环素100mg，口服，每日2次.连续7~14天或阿齐霉素1.0g，单剂量口服，半衰期长达60h，可维持有效浓度5天;或司巴沙星0.2g，口服，每日1次，连续7天;或氟嗪酸0.2g，口服，每日2次，连续7~14天;或红霉素0.5g，口服每日4次，连续7一14天;或氧氟沙星0.3g，口服，每日2次，7～14天;或左氧氟沙星0.5g，口服，每日1次，7一14天;或罗红霉素0.3g，口服，每天1次，共7天;或0.15g，口服，每天2次，共7天;或二甲胺四环素(美满霉素)(mdnocycline)1.0g，口服，每天2次，连续7～14天。
(2)妊娠期妇女：红霉素500mg，口服，每日4次，连续7天;或红霉素250mg，口服，每日4次，连续14天;或阿奇霉素1.0g，1次口服;或羟氨苄青霉素500mg，口服，每日3次，共7～10天。关于羟胺苄青霉素的有效性，现有资料较少。
(3)新生儿眼结膜炎或新生儿肺炎：均可使用红霉素每日50mg/kg，分4次口服，连续10～14天。
(4)儿童：衣原体感染，体重<45kg儿童，红霉素每日50mg/kg，分4次口服，共10一14天;体重≥45kg，但年龄<8岁的儿童治疗方案同成年人，红霉素方案相同，即红霉素0.5g，每日4次，连续7天;年龄>8岁的儿童治疗方案同成年人强力霉素或红霉素方案。即强力霉素100mg，口服，每日2次。连续7天，红霉素0.5g，口服，每日4次，连续7天。阿齐霉素1.0g，1次口服。
(5)合并HIV感染者：与HIV的患者相同。
(6)复发或持续NGU的处理：
1)处理男性复发NGU十分困难。多数NGU复发者CT和UU培养阴性，其复发病因常不明了。国外报道，四环素或大环内酯类药物7日以上治疗，几乎能全部消除男子的沙眼衣原体。尽管沙眼衣原体显然已被清除。
2)排除性伴未治疗或发生再感染的可能性以后，耐四环素解脲支原体是持续性尿道炎病因，如果未查出其他原因，用红霉素(500mg，每日4次，共14天)或司巴沙星(0.2g，每日1次，连续7天)。多数男性在进行第2个疗程后，症状再改善，但近30％患者症状再复发。此时，应考虑是否有滴虫感染，凭经验试用甲硝唑。
同时还应考虑有无生殖器疱疹
3)对上述患者处理尚需参考下列各项：①检查有无合并前列腺炎，其常是复发或持续NGU的原因。②有无菌群紊乱，大量抗生素可致条件致病菌感染，要慎重分析培养出的微生物是否是致病病原体，并酌情作相应的处理。③许多患者经检查后确无衣原体、支原体所致炎症的证据，而医师只是简单重新开具抗生素，并非上策。④要使患者消除疑虑，不必无限制再用抗生素。⑤即使不再治疗，多数男性患者症状随着时间的推移可能消退。
非淋菌性尿道炎的症状和治疗方法，具体如下： 1、症状：主要包括尿频、尿急、尿痛、尿道口瘙痒、红肿、分泌物增多等，严重时还可能导致分泌物带血或血尿，还可能伴有尿不尽、腹部坠胀、腹部疼痛、发热，恶心、呕吐等症状。 2、治疗方法：在治疗上，可以在医生的指导下服用盐酸莫西沙星片、阿奇霉素胶囊、罗红霉素胶囊、盐酸米诺环素胶囊、盐酸多西环素片、盐酸左氧氟沙星胶囊、磷霉素钙胶囊等药物。 在日常生活中，患者也要多喝水，戒烟戒酒，避免吃辛辣刺激性食物，保持规律性生活，注意个人卫生，勤洗澡，勤换洗内裤，注意休息，避免熬夜，避免过于劳累，放松心情，如果身体出现不适症状，要及时到医院就诊，避免耽误治疗。
一般来说，非淋菌性尿道炎的患者吃大环内酯类的药物、四环素类的药物、喹诺酮类的药物、中成药物是比较好的。 1、大环内酯类的药物：主要包括阿奇霉素胶囊、罗红霉素胶囊等，吸收的效果比较快，对胃肠道造成的刺激也比较小，可有效缓解不适症状。 2、四环素类的药物：主要包括盐酸米诺环素胶囊、盐酸多西环素片等，吸收比较迅速，治疗效果是比较好的。 3、喹诺酮类的药物：包括盐酸左氧氟沙星片、盐酸莫西沙星片等，作用比较迅速，所引起的不良反应也比较少。 4、中成药物：比如热淋清颗粒、三金片等，具有一定的治疗作用。 在服用期间要谨遵医嘱，避免擅自服用，以免影响身体健康。
患者可以通过使用抗生素药品的方法实施消炎解决，这样可以在短时间内控制病情的扩张，起些一定的救治疾病的效果，但是有的患者如果再次出现了疾病反反复复复发的现象，也可能会致使其他器官再次出现了感染性炎症的产生，甚至致使癌变。但是总体而言这个病癌变的几率并不高。
患者可以通过使用抗生素药品的方法实施消炎解决，这样可以在短时间内控制病情的扩张，起些一定的救治疾病的效果，但是有的患者如果再次出现了疾病反反复复复发的现象，也可能会致使其他器官再次出现了感染性炎症的产生，甚至致使癌变。但是总体而言这个病癌变的几率并不高。
淋球菌性尿道炎通常持续2-4周，或数月。非淋球菌性尿道炎的潜伏期比淋球菌性尿道炎的潜伏期长。一般是2-4周，可能有几个月以上。潜伏期通常无症状。典型症状是尿道瘙痒,伴随着紧迫感,疼痛,排尿困难,尿频,少量的粘液分泌尿道口,有时痂膜密封或胯部污染,尿道炎发生的潜伏期后,积极的去医院接受治疗,口服抗生素可用,这将有一个良好的效果。在平时应该注意卫生。无症状携带者在出现症状时错过了治疗机会而转向慢性病;10-20％的淋球菌性尿道炎患者，非淋球菌性尿道炎治疗不当，附睾炎、前列腺炎等。
淋菌性尿道炎，女性传染绝大部分病人通常不会有任何症状。但是也有极少数病情比较严重的患者会再次出现阴道坠胀感，尿频，尿急等。当该病原体蔓延到宫颈后，女性朋友会再次出现白带增多，混浊，子宫颈有水肿，冲血甚至是糜乱。平时注意个人卫生，惯良好的生活习惯。
淋菌性尿道炎主要通过性碰触散播，而非淋菌性尿道炎可能会是由于缺少对清洁卫生的观注引发的。因此，两者传染的病原菌不同，传染方式也不同。如果明确确诊为淋菌性尿道炎，建议同时留意清洁局部皮肤、经常泡澡、经常换新内裤和积极动用抗生素。平时留意饮食，不吃辛辣刺激的食物。需要强调的是多吃水果蔬菜，加强体育锻炼，增加机体抵抗力。
淋菌性尿道炎也称为特异性尿道炎，是由淋球菌引起的泌尿生殖系统化脓性感染，急性淋菌性尿道炎的潜伏期一般为二到十天，平均为二到五天，开始烧灼感、瘙痒、发红和尿道口外翻，排尿时灼痛，伴有尿频，尿道口有少量粘液分泌物，三到四天后，尿道粘膜上皮大部分出现局灶性坏死，产生大量脓性分泌物，排尿时刺痛，龟头和包皮明显红肿，尿道中可见细丝或血液，早上尿道口会形成脓疮，伴有不同严重程度的全身症状，慢性淋菌性尿道炎通常没有明显症状，当身体抵抗力下降时，如过度疲劳、饮酒和性交，尿道炎症状会再次出现，但炎症比急性期轻，尿道分泌物少而薄，只有在早上，脓疮才会附着在尿道口，如果患有淋菌性尿道炎，可以到专业的地方，在专业的指导下采取积极正确的治疗措施。
治疗非淋菌性尿道炎疾病还可以使用四环素药物来对症的治疗，期间必须要注意局部的清洁卫生，防止局部遭到任何的传染，这种疾病也是一种性病，所以说必须要在治疗疾病期间严令禁止性生活。如果是拥有非淋菌性尿道炎的话，那么治疗期间还要预防工作会有淋病的再次发生，也要注意后期梅毒疾病，所以说局部的清洁解决必须要得当，还要注意适量的饮食习惯。
按上述情况：检验有支原体感染非淋菌性尿道炎用药最好是中药治疗，多喝水留意饮食留意防寒不能够吃辛辣油炸寒冷食物，吃点药调养一下。治疗，阿奇霉素、石淋通四粒，知柏地黄丸一天三次饭后吃。此外患者日常需要规律作息、做好防寒保暖工作、日常饮食多吃清淡稀软的食物、勤通风和多喝热水，以此确保病情不反复。
