比较多样，与肠内病变的部位、范围、严重程度、病程长短以及有无并发症有关。典型病例多在青年期缓慢起病，病程常在
数月至数年以上。活动期和缓解期长短不一，相互交替出现，反复发作中呈渐进性进展。少数急性起病，可有高热、毒血症状和急腹症表现，多有严重并发症。
偶有以肛旁周围脓肿、瘘管形成或关节痛等肠外表现为首发症状者。本病主要有下列表现。
(一)腹泻常见(87%~95%。多数每日大便6~9次，一般无脓血或粘液；如直肠受累可有脓血及里急后重感。
(二)腹痛常见(50%-90%)。多位于右下腹，与末端回肠病变有关。餐后腹痛与胃肠反射有关。肠粘膜下炎症刺激痛觉感受器，使肌层收缩，肠壁被牵拉而剧痛
白细胞移动抑制试验亦呈异常反应，说明有细胞介导的迟发超敏现象；结核菌素试验反应低下；二硝基氯苯(DNCB)试验常为阴性，均支持细胞免疫功能低下。近年来还发现某些细胞因子，如II-1,2,4,6,8,10,y干扰素和a肿瘤坏死因子等与炎症性肠病发病有关。说明CD的发病可能与免疫异常有一定关系。
以上提示本病存在遗传倾向。
溃疡性结肠炎或克罗恩氏病的诊断通过临床、放射学、内窥镜和组织学检查确定。将不确定结肠炎病人从研究中排除。6%克罗恩氏病病人是NOD2纯合子。溃疡性结肠炎病人没有属于这一类的，对照组也没有NOD2纯合子。NOD2杂合子存在于18%的克罗恩氏病、6%的溃疡性肠炎病人，以及8%的对照。Hampe等人指出，突变少见，只有6.5%的克罗恩氏病病人是纯合子。这种突变为克罗恩氏病的发生提供了高度风险。NOD2和溃疡性肠炎之间没有相关性，但是NF-κB活化在克罗恩氏病强于溃疡性肠炎。
本病的病变呈节段分布，与正常肠段相互间隔，界限清晰，呈跳跃区(skiparea)的特征。急性期以肠壁水肿炎变为主；慢性期肠壁增厚、僵硬，受累肠管外形呈管状，其上端肠管扩张。粘膜面典型病变有:①溃疡:早期浅小溃疡，后成纵行或横行的溃疡，深入肠壁的纵行溃疡即形成较为典型的裂沟，沿肠系膜侧分布。肠壁可有脓肿。②卵石状结节:由于粘膜下层水肿和细胞浸润形成的小岛突起，加上溃疡愈合后纤维化和疤痕的收缩，使粘膜表面似卵石状。③肉芽肿:无干酩样变，有别于结核病。肠内肉芽肿系炎症刺激的反应，并非克罗恩病独有；且20%~30%病例并无肉芽肿形成，故不宜称为肉芽肿性肠炎。
④瘘管和脓肿:肠壁的裂沟实质上是贯穿性溃疡，使肠管与肠管、肠管与脏器或组织(如膀耽、阴道、肠系膜或腹膜后组织等)之间发生粘连和脓肿，并形成内瘘管。如病变穿透肠壁，经腹壁或肛门周围组织而通向体外，即形成外瘘管。
肠结核和克罗恩的区别主要表现在病因、临床表现及相关检查三方面:首先，在病因上。肠结核是由于肠道感染了结核杆菌。而克罗恩只是一种炎症性的肠病和感染无关。其次，临床表现上。肠结核会出现低热、盗汗等结核病的表现，也会出现肠道的表现，如腹痛、腹泻、便秘等。而克罗恩病无结核表现，主要表现为肠道系统的症状。除此之外，在检查上两者也有明显的区别。在结肠镜下肠结核的黏膜可以形成横行、浅表，且不规则的溃疡。而克罗恩病呈纵行裂隙状，并且肠结核抗酸杆菌染色多为强阳性。
肛瘘不能排除克罗恩病，肛瘘是和平时期长期便秘引起的，它与不良的饮食习惯和忽视个人卫生密切相关，肛瘘是发生在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变。一般有一个通畅的完整的管道，一头在肛窦，一头在肛缘外，或在直肠壁。而克罗恩病是是一种原因不明的肠道炎症性疾病。临床表现为腹痛、腹泻、肠梗阻，所以说克罗恩病不是肛瘘。主要的表现是在肛缘触及索条状硬块，按压轻度疼痛，一定要及时的调理，不可以一拖再拖，以免病情加重，错过最佳的治疗时期。
肠瘘是指体外肠、肠与其他器官或器官之间的病理通道引起的一系列病理生理变化，如感染、体液流失、营养不良、器官功能障碍等。如果手术后发生这种情况，很可能会影响患者的正常生活，也会影响患者的饮食情况，所以这种情况可以到医院进行相关检查，然后用外科方法进行治疗，通常患者应该多注意休息，随时是时候观察他们的情况了。克罗恩病是一种病因不明的胃肠道慢性炎症性肉芽肿性疾病，易发生内瘘、外瘘等并发症。建议您保持冷静，及时到当地正规医院进行腹部手术。
肛瘘不能排除克罗恩病，肛瘘是和平时期长期便秘引起的，它与不良的饮食习惯和忽视个人卫生密切相关，肛瘘是发生在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变。一般有一个通畅的完整的管道，一头在肛窦，一头在肛缘外，或在直肠壁。而克罗恩病是是一种原因不明的肠道炎症性疾病。临床表现为腹痛、腹泻、肠梗阻，所以说克罗恩病不是肛瘘。主要的表现是在肛缘触及索条状硬块，按压轻度疼痛，一定要及时的调理，不可以一拖再拖，以免病情加重，错过最佳的治疗时期。
克罗恩病患者可以适量食用葡萄等营养丰富、口感酸甜的水果及蔬菜，如苹果、香蕉、木瓜、杨梅、石榴、火龙果、胡萝卜、白菜、芹菜、冬瓜、番茄等，以补充能量，提高免疫力，但需注意适量，以防增加胃肠道负担，导致消化不良。同时，患者应多休息，避免劳累，保暖，适量运动，并在症状严重时及时就医，以避免延误治疗。
溃疡性结肠炎与克罗恩病作为两种病因不明的非特异性炎性肠病，它们在病变部位、临床症状以及肠镜下和影像学改变上存在显著差异。克罗恩病易于影响回肠末端或右半结肠，患者多表现出右下腹部的隐约疼痛、腹痛与腹泻，但无里急后重现象；而溃疡性结肠炎则倾向于影响乙状结肠和直肠下端，其疼痛多位于左下腹部，在急性发作时伴有血样大便及里急后重。肠镜检查下，克罗恩病表现为阶段性病灶，特征性为“铺路石样”改变，而溃疡性结肠炎则显示为连续性的肠道病变。这些差异有助于临床医生在诊断时进行准确区分。
肛瘘4个月不结疤，正常情况下和克罗恩病是没关系的，肛瘘是由于，如果再次出现了疾病的传染就会容易影响到组织的结疤。可以采取挂线的疗法来实施救治，要去医院复诊，如果中间有脓肿的话，要动用抗生素的药物来实施用药，同时要做个肠镜仔细检查来理解可有患上克罗恩病。需要声明注意多喝白开水，多吃新鲜蔬菜水果，不要长时间久坐。
肛周脓肿与克罗恩病也有一定的关系。克罗恩病主要的症状就是反复出现腹泻，因为腹泻次数多，粪便内的细菌会反复刺激肛门，导致局部出现细菌感染而引起急性的化脓性脓肿，肛门出现疼痛、灼热下坠感，并有瘙痒症状。此种情况必须要用药治疗克罗恩病，控制腹泻，并要注意局部的清洁卫生，每次便后用温水洗干净肛门。同时需做手术切开脓肿进行排脓，再静脉点滴抗生素抗炎治疗，结合局部用中药洗剂坐浴，促进炎症的逐渐吸收消退。因此，肛周脓肿与克罗恩病是有关系。
肠道痉挛有可能是克罗恩病引起的。因为克罗恩病是一种局限性肠炎，常发生于末端回肠与临近右侧结肠，呈节段性分布。临床以腹痛、腹泻、腹部肿块、肠梗阻和漏管形成为主要特点，也可有贫血、发热、营养障碍等症状。临床表现多出现腹痛，常于进餐后加重排便或排气后可缓解，腹痛的发生可能与肠内容物通过炎症和狭窄长段引起局部肠痉挛有关。
肛裂不一定是克罗恩病引起的，因为克罗恩病主要发生在回肠和右半结肠，是肠道慢性炎症性疾病，一般不引起肛裂。而肛裂的形成，往往跟长期便秘、肛门内括约肌痉挛、肛管先天发育异常等导致的。肛裂容易导致溃疡、疼痛、出血等症状，长期出血会导致贫血，如果出血量大的话，也可能出现失血性休克。所以肛裂的患者，需要及早诊治，必要时手术治疗。
