白塞氏病患者全身各系统均可受累，如口腔、皮肤、关节、消化道、眼部、血管、肺部等，但只有较少数的患者可同时出现多种临床表现，有时患者需经历数年甚至更长时间才相继出现各种临床症状和体征，白塞氏病患者中约半数以上患者的双眼可出现病变。
多数白塞氏病患者会出现眼部病变
白塞氏病患者眼部病变可以在起病后数月，甚至几年后出现，眼受累致盲率可达25％，是本病致残的主要原因。其表现为视物模糊、视力减退、眼球充血、眼球痛、畏光流泪、异物感、飞蚊症和头痛等。通常表现为慢性、复发性、进行性病程。
最常见和最严重的眼部病变为色素膜炎，前葡萄膜炎即虹膜睫状体炎，可伴有或不伴有前房积脓，而后葡萄膜炎和视网膜炎则是影响视力的主要原因。眼球其余各组织均可受累，出现角膜炎、疱疹性结膜炎、巩膜炎、脉络膜炎、视网膜炎、视神经乳头炎、坏死性视网膜血管炎、眼底出血等。
除此之外，患者可有晶状体出血或萎缩、青光眼、视网膜脱落。单独视盘水肿提示脑静脉血栓，由白塞病所致的颅内血管病变可导致视野缺损。
