慢性肝炎病原治疗的目的为抑制病毒复制，减少传染性;改善肝功能;减轻肝组织病变;提高生活质量;减少或延缓肝硬化的发生，符合其适应证者应尽可能进行抗病毒治疗，主要治疗药物包括：
1、干扰素
可用于慢性乙型肝炎和丙型肝炎的抗病毒治疗，本药主要通过诱导宿主产生细胞因子起作用，在多个环节抗病毒，包括阻止病毒进入细胞、降解病毒mRNA，抑制病毒蛋白转录，抑制病毒增强子活性等。
干扰素治疗慢性肝炎的效果与病例选择有明显的关系，肝炎处于活动期，ALT(丙氨酸转氨酶)升高;病程短;女性;HBVDNA(乙型肝炎病毒DNA)滴度低;组织病理有活动性炎症存在等因素都有利于提高干扰素的疗效。
2、拉米呋啶
本药是一种逆转录酶抑制剂，具有较强的抑制HBV复制的作用，可使HBVDNA水平下降或转阴，ALT复常，改善肝组织病变，其作用机制是竞争性抑制HBVDNA聚合酶，参与到HBVDNA合成过程中阻止新链生成。
需要注意的是，拉米呋啶虽可抑制病毒复制，但是不能清除细胞核内共价闭合环状DNA(cccDNA)，停药后cccDNA又启动病毒复制循环。
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