腿疼做CT好还是核磁共振好不可一概而论，首先要明确是什么原因引起的腿疼，若是外伤导致的腿疼，首先可以拍片检查，明确有没有骨折，再根据骨折的具体情况选择ct检查。如果是膝关节受到了外伤，除完善ct检查外，还要检查磁共振，明确有没有半月板以及交叉韧带的损伤。若腿疼是腰椎间盘突出症导致，最好完善核磁共振检查。若是膝关节或者髋关节的滑膜炎导致的疼痛，需要完善磁共振检查。